原本还算有着可爱的脸蛋，可是不知为何总给人一种阴冷诡异不好接近的感觉。这便是刚刚升入高中不久的黑木智子（橘田いずみ 配音），她蓬头垢面，少言寡语，脸上是极度痴迷游戏后留下的黑眼圈。原本以为自己会成为乙女游戏中众星捧月的校花，谁知却注定要成为没有朋友、无人关注的丧女。更无法忍受的，是初中与之同类型

　　精灵和人类，以及神曲。　　只是以这三个部分所组成世界“POLYPHONICA”为背景的故事。人与精灵共存，同时精灵也拥有着力量，两者所生活的大陆——POLYPHONICA。人们依赖着精灵所带来的奇迹，精灵也以人类所奏的音乐为食量，在这个世界所有的物质以及一切地方发挥着她们的力量。精灵被音乐家所弹

　　20世纪末，15岁的少年榊原恒一（阿部敦 配音）由于父亲前往海外公干的原因，于是来到亡母的家乡夜见山市，暂住阿姨三神怜子（宮牧美沙代 配音）家中等待转入新的学校。在此期间，他的旧病复发，入院治疗，某晚，恒一在空荡荡的走廊内邂逅一名穿着水手服、左眼戴着眼罩但阴气逼人的美少女，这似乎预示着一段不平凡