真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练神奇宝贝的资格。10岁的少年小智（松本梨香 配音）以成为最厉害的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上了修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选神奇宝贝的资格，无奈下他领走了一只被挑剩下的神奇宝贝——皮卡丘（大谷育江 配音）。皮卡丘又名电气鼠，虽然长相可爱，但

　　冬空凩（小野友树 配音）自幼就有着比一般人强烈的灵感力，常常会遭到幽灵的附身，人生因此一直都不是很顺利，甚至因此而背负上了巨额的债务。无奈之下，冬空凩只得到处寻找容身之处，就这样来到了名为摇曳庄的温泉旅馆之中。            

　　蕾是个非常喜欢花草植物的中学二年级生，绘里香是个喜欢服装设计的中学二年级生，某日她们梦见了在一个充满美丽花草的地方，还有妖精四处飞舞····· 　　而就在几天后转学到明堂学园的蕾，真的遇上了在梦里见到的妖精，妖精也向蕾表示，希望她能够为守护“心之大树”、并让大家的“心之花”绽放而战······一

　　家财万贯，个性强势占有欲极强的道明寺司（宫下直纪 配音），个性孤僻沉默寡言的花泽类（山本耕史 配音），容貌姣好风流倜傥，在女性中有极高呼声的西门总二郎（赤井田良彦 配音），只喜欢年长女性的少妇杀手美作玲（望月祐多 配音），在白金级贵族学院英德学院中，这被称为“F4”的四人的大名无人不知，敢于反抗

　　即将升上初中二年级的朝日奈未来，在春假的某天晚上，看到一神秘物体从天落入附近的公园里。“难道是魔法使？”，兴奋的未来第二天一早就和自小就喜爱着的绒毛玩具熊“毛芙伦”一起向公园前进。结果在那里看到的是……骑着扫帚漂浮在空中的女孩……自称是理子的那个女孩子，竟然是魔法使。　　未来对魔法使非常感兴趣，

　　黄金国王和猫眼石王后相爱结合，诞下了可爱的银公主（德光由香 配音），国王和王后实在是太喜欢这个拥有一头耀眼银发的小姑娘了，无度的宠爱着她，使得银公主养成了十二中坏习惯。武烈女王曾是蜡笔王国的第三十三代女王，她打败了死神的英勇事迹传到了银公主的耳中，使得银公主对武烈女王无比崇拜。　　一转眼，银公主

　　在遥远的地方，有一个洋溢着各式各样的童话故事、可爱和快乐的国家“童话国度”（Märchen Land）。然而，恶之皇帝皮耶罗（Piero）把“童话国度”的女王彻底封印。精灵糖糖（Candy）随即前往地球，寻找传说中的战士“光之美少女”。　　转学生星空幸接获一本从天而降的绘本，里头的精灵糖糖竟然实